当员工自动离职后，公司社保的处理方式如下：

一、公司责任

社保关系转移：

根据《中华人民共和国劳动合同法》和《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，即使员工自动离职，公司也有责任为其办理社保关系的转移手续。

公司应在解除或终止劳动合同时，出具解除或终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。

停止缴费：

员工自动离职后，公司通常会在下一个社保缴费周期停止为其缴纳社保费用。但具体停止时间可能因公司的社保缴纳周期和离职时间而异。
 

二、员工权益与后续处理

社保关系保留：

员工自动离职后，其社保关系并不会立即终止，而是会保留在原社保账户中。

社保账户中的个人缴费部分和单位缴费部分(个人账户部分)将继续存在，并受到法律保护。

个人处理方式：

尽快找到新工作：如果员工在离职后很快找到了新的工作，可以请新单位继续为其缴纳社保。员工需要向新单位提供个人的社保账户信息，以便新单位为其办理社保关系的转移和续缴手续。

以灵活就业人员身份自行缴纳：如果员工暂时没有找到新工作，或者选择自主创业、成为自由职业者等，可以考虑以灵活就业人员的身份自行缴纳社保。通常包括养老保险和医疗保险，具体缴费标准和流程需咨询当地社保部门。

申请社保暂停：如果员工在短期内不打算继续缴纳社保，可以向社保部门申请暂停社保。但需要注意的是，社保暂停期间，员工将无法享受社保待遇，且可能会对养老保险的累计缴费年限产生一定影响。

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注意事项：

及时办理手续：无论是转移社保、自行缴纳还是申请暂停，员工都应尽快办理相关手续，避免产生不必要的麻烦和损失。

保存好相关凭证：在办理社保相关业务时，员工应保存好各类凭证，如缴费单据、转移证明等，以备日后查询和使用。

关注社保政策变化：社保政策可能会随着时间和地区的不同而有所调整，员工应及时关注相关政策变化，确保自己的权益得到保障。

三、特殊情况

社保退费：

一般情况下，社保费用是不可以退费的。因为社保费用是由用人单位和个人依法缴纳的，用于社会保险的各项支出，一旦缴纳就产生了相应的权益。

但也存在一些特殊情况，如员工达到法定退休年龄但社保缴费不足15年时，可以选择一次性领取个人账户储存额或者转入其他社会保险制度;员工在缴费期间死亡或者出国定居的，也可以申请领取其个人账户储存额。然而，这些情况并不适用于自动离职的员工。

视同缴费：

对于自动离职人员而言，如果在特定时期有工作年限但未实际缴费，可能涉及“视同缴费”的问题。但这一规定因地区和政策而异，具体需咨询当地社保部门。

综上所述，员工自动离职后，公司应依法为其办理社保关系的转移手续，并停止为其缴纳社保费用。员工则应根据自身情况选择合适的社保处理方式，并关注相关政策变化，确保自己的社保权益得到保障。